Thinking more...

在 archlinux 裡，執行 yaourt -Syu 以後，出現這訊息：

failed to initialize alpm library (database is incorrect version)

Google 到這篇：Failure to initialise alpm library：archlinux，裏面有提到原因，是因為 yaourt 更新 pacman 以後，沒更新 pacman 資料庫的關係，執行 sudo pacman-db-upgrade 以後就沒問題了。